В регионе работает один пригородный маршрут и два межмуниципальных.
По данным регионального минтранса, с начала навигационного периода в Омской области, который стартовал в мае 2024 года, водным транспортом уже воспользовались более 12 тыс. человек. В регионе функционируют три основных направления: пригородный маршрут «Центр — "Зеленый берег"» и два межмуниципальных: «Омск — Большеречье» и «Большая Тебендя — Кайсы».
С мая по июль на маршруте «Большая Тебендя — Кайсы» было перевезено 5 007 пассажиров на катерах «Строительный №356» и «Строительный №360», которые могут вместить по 26 человек каждый. Эти перевозки осуществляются ежедневно до конца октября.
Межмуниципальный маршрут «Омск — Большеречье» также пользуется спросом: им воспользовались 959 человек. Теплоход «Заря-353» вместимостью 45 человек отправляется из Омска по вторникам и субботам, а из Большеречья — по средам и воскресеньям.
Пригородным маршрутом «Центр — "Зеленый берег"» воспользовались 6 675 человек. Теплоход «Москва-126», вмещающий до 200 пассажиров, курсирует по средам, пятницам, субботам и воскресеньям.
Все маршруты являются социально значимыми и субсидируются из регионального бюджета, что делает стоимость проезда более доступной для населения.