Из биографии Сергея Канунникова (1956 года рождения) известно, что он омич, первое профессиональное образование получил в авиационном техникуме имени Жуковского. После окончания техникума в 1975 году был призван в армию, службу проходил в инженерных войсках Московского военного округа. Демобилизовался в 1977 году, а в 1978-м поступил на рабфак Омского государственного университета. В 1979 году был зачислен на исторический факультет. После университета пять лет — с 1984-го по 1989-й — работал заместителем директора по учебно-воспитательной работе в СПТУ-3. В 1989 году назначен директором школы № 143. 16 апреля 2001 года назначен начальником управления образования администрации города Омска.
Сергей Канунников — отличник народного просвещения, заслуженный учитель России, кандидат педагогических наук. Кандидатскую диссертацию на тему «Формирование профессиональной направленности учащихся в физкультурно-педагогических классах» защищал на кафедре педагогики и психологии СибГУФКа.
До последнего времени работал руководителем Центра довузовской подготовки и профориентации ОмГУ.